Genome-TALER? TALEN 和 TALE定制服務

TALEs首先是在植物病原菌黃單胞菌(Xanthomonas)中發(fā)現(xiàn)的。當感染植物時，病原菌分泌的TALEs識別宿主植物靶基因的啟動子區(qū)，調(diào)控相應基因的表達。TALE蛋白中間含有一個重復區(qū)域，該區(qū)域由33-35個氨基酸的重復單元組成。每個重復單元的氨基酸序列高度保守，除了第12位和13位的兩個氨基酸可變，即重復單元可變的雙氨基酸殘基（RVD）。TALE單體通過RVD識別DNA靶點上的堿基，有如下一一對應關系：NI = A, HD = C, NG = T,NN = G 或 A。

轉錄激活因子樣效應子(TAL effectors)已廣泛應用于靶向基因組操作蛋白的制備：通過融合表達核酸酶、轉錄因子或其他功能的結構域構建位點特異的內(nèi)切酶（TALEN）、靶基因轉錄調(diào)控因子（TALE-TFs）或者其他基因組修飾蛋白。TALE融合蛋白通過TALE特異性識別結合染色體上靶序列進行靶向基因組編輯，比如基因敲除、基因敲入（結合使用重組供體質(zhì)粒）、基因組修飾、基因轉錄激活或抑制等。不同于識別3聯(lián)體堿基的鋅指蛋白，TALE單體通過一一對應的關系精確識別單個堿基（A, T, C, G），因此可以針對基因組上任意目標序列設計組建TALE模塊。

圖 1. TALEN設計示意圖

圖 2. TALE-TF設計示意圖

TALEN 及 CRISPR-Cas9 體系應用對比

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